โกโก้มีตัวต้านอนุมูลอิสระ (antioxydant) ซึ่งเป็นสาร polyphenol ที่สามารถชะลอการตายของเซลล์ได้ อีกทั้งป้องกันการเกิดภาวะแข็งตัวของหลอดเลือดแดง (artherosclerosis) และลดระดับ cholesterol ตัวร้าย คือ low density lipoprotein (LDL) ที่ชอบพอกตัว จับอยู่ที่ผนังของหลอดเลือดแดง อันเป็นสาเหตุสำคัญที่ทำให้เป็นโรคหลอดเลือดหัวใจอุดตัน และโรคหลอดเลือดสมองตีบ
สำหรับผลของโกโก้ที่มีต่ออารมณ์และจิตใจนั้น นักวิทยาศาสตร์ได้พบว่า โกโก้สามารถกระตุ้นให้สมองหลั่งสาร dopamine และ serotonin ซึ่งทำให้คนบริโภคมีอารมณ์ดี และมีความสุข ดังนั้น โกก้จึงสามารถป้องกันและรักษาโรคซึมเศร้าได้บ้างเพราะขณะคนมีอาการเหล่านี้ สมองจะขาดสาร serotonin และ dopamine